二战风云中的海军战争玩法具有鲜明的历史还原性和策略深度，其核心特点体现在舰种分工、战术配合、资源管理以及战场环境模拟等方面。海军作为三军之一，在游戏中占据重要地位，拥有强大海军的玩家往往能掌握战场主动权。早期阶段潜艇部队凭借隐蔽性和突袭能力成为性价比之选，而游戏进程推进，战列舰和航空母舰则逐渐成为舰队主力，前者以火力与防御见长，后者通过舰载机扩展制空权与远程打击能力。不同国家的海军设计也反映了历史特色，例如日本海军侧重大型战舰与航母组合，德国则依赖潜艇群破坏海上运输线。
海军战斗的胜负不仅依赖舰船属性，更强调阵型配置与战术选择。炮塔作为舰艇核心武器，其类型和射程直接影响战斗效率，例如德国战列舰采用旋转式炮塔实现快速转向射击，日本战舰则注重长炮设计以提升射程优势。防空火力薄弱是二战前各国海军的通病，因此在游戏中需通过后期升级弥补这一缺陷。战斗中需合理利用地形掩护，例如珊瑚礁区域可限制敌方大型舰船机动，而开阔海域则适合航母发挥空中优势。潜艇的鱼雷偷袭和驱逐舰的反潜配合，进一步丰富了战术层次。
资源分配与舰队养成是长期发展的关键。海军单位造价高昂，需平衡早期潜艇骚扰与后期主力舰投入的节奏。日常训练、联盟合作以及参与特定活动能加速舰队成长，例如通过历史战役任务获取稀有舰船蓝图。舰队编成需考虑克制关系，如航母克制战列舰但惧怕潜艇，驱逐舰反潜高效却难以对抗巡洋舰。科技研发应优先提升命中率、装甲强度和机动性，这些属性直接影响舰船在复杂海况下的生存能力。
游戏通过动态天气系统模拟真实海况，风暴会降低舰炮精度，夜间战斗则强化潜艇隐蔽性。历史事件如珍珠港偷袭或中途岛战役可能作为特殊剧本出现，玩家需根据情报调整部署。海域控制权争夺往往需要多军团协作，包括建立前线基地、切断敌方补给线等行动。海军战争的终极目标是建立立体化攻防体系，通过海空协同与后勤保障实现制海权压制。
